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细胞培养中支原体微生物检测的必要性及方法

三方检测单位 2020-01-10

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细胞培养是生物医学研究、药物开发及细胞治疗的基础技术,但支原体感染是其最常见且隐蔽的“隐形杀手”。支原体是一类无细胞壁的原核微生物,直径仅0.2-0.3μm,能通过0.22μm滤菌器,感染率可达30%~60%。它不会引起培养基浑浊或细胞形态明显改变,却能掠夺细胞营养、分泌毒性物质,干扰细胞代谢、增殖及基因表达,直接威胁实验结果的可靠性。本文将从支原体的危害、检测的核心必要性及常用方法入手,解析细胞培养中支原体检测的实践逻辑。

支原体对细胞培养的隐性威胁:看不见的“代谢掠夺者”

支原体的隐蔽性源于其特殊结构:无细胞壁导致它不会被革兰氏染色识别,代谢缓慢也不会引起培养基浑浊。但它对细胞的伤害却“潜移默化”——首先,支原体依赖细胞的营养生存,会消耗培养基中的葡萄糖、氨基酸和胆固醇,导致细胞因营养匮乏而生长缓慢;其次,它会分泌过氧化氢、核酸酶等毒性物质,损伤细胞DNA,引发氧化应激反应;再者,支原体还会干扰细胞因子分泌,比如感染间充质干细胞后,IL-6、TNF-α等炎症因子的表达量可升高2-3倍,直接抑制干细胞的分化能力。更关键的是,早期感染的细胞形态无明显变化,往往等到细胞出现皱缩、脱落时,感染已扩散至整个培养体系。

比如在肿瘤细胞培养中,感染支原体的HeLa细胞增殖速率会下降约40%,且对凋亡诱导药物的敏感性显著降低——这意味着如果用这样的细胞做药物筛选,得出的“有效浓度”可能完全偏离真实值。

为什么常规无菌检测无法覆盖支原体?

实验室常用的无菌检测方法(如肉汤培养、革兰氏染色、细胞形态观察)本质上是针对细菌、真菌的“可见污染”设计的:肉汤培养通过观察浑浊判断污染,革兰氏染色通过细胞壁着色识别细菌,细胞形态观察则依赖于污染物引起的细胞病变。但支原体既不会让肉汤浑浊,也无法被革兰氏染色,早期感染更不会改变细胞形态——这就导致常规方法对支原体“完全失明”。

曾有实验室用常规无菌检测确认“无污染”的细胞,后续通过PCR检测发现支原体阳性率高达25%。这说明,要排查支原体感染,必须用专门的检测方法。

支原体检测的核心必要性:守住实验结果的“可信度底线”

支原体检测的意义远不止于“去除污染”,更在于保障实验结果的可靠性。首先,在药物研发中,支原体感染会改变细胞的代谢途径——比如感染支原体的肝细胞对降脂药物的摄取能力下降30%,导致药物筛选结果偏差;其次,在基因编辑实验中,支原体会影响细胞的转染效率:研究发现,感染支原体的293T细胞转染GFP质粒后的阳性率从80%降至45%,因为支原体损伤了细胞表面的脂质筏结构,抑制了脂质体的融合;再者,发表学术论文时,《Cell》《Nature》等顶级期刊明确要求提供细胞无支原体感染的证明,若未检测,论文可能直接被拒稿。

对细胞治疗产品而言,支原体检测更是“生死线”——比如CAR-T细胞疗法中,支原体感染会引发患者的免疫反应,严重时可导致败血症,因此FDA要求细胞治疗产品必须通过支原体检测才能进入临床。

常用支原体检测方法之培养法:经典但耗时的“金标准”

培养法是支原体检测的经典方法,其原理基于支原体在专用培养基上生长形成的“煎蛋状”菌落——中心致密、周围稀疏,形似煎蛋。这类培养基需包含马血清(提供胆固醇,满足支原体的膜合成需求)、酵母浸出液(提供核酸前体)和青霉素(抑制细菌污染)。

具体步骤包括:取细胞上清或培养基,通过0.45μm滤膜过滤(去除细菌),同时接种到固体琼脂培养基和液体肉汤培养基;将固体培养基放入37℃、5%CO₂培养箱孵育,每周用低倍镜观察是否有“煎蛋”菌落;液体培养基则通过酚红指示剂判断——支原体代谢会使pH下降,酚红由红变黄。

培养法的优势是“准确”,能直接证明支原体的活性,是国际公认的“金标准”;但缺点也明显:耗时2-4周,无法满足快速筛查需求,更适合感染后的确认或溯源。

PCR法:快速精准的主流选择

PCR法是目前实验室最常用的支原体检测方法,其核心逻辑是针对支原体的“保守基因”设计引物——比如16S rRNA基因(所有支原体都含有的高度保守序列)或ATPase基因,通过扩增这些基因判断是否存在支原体。

具体步骤分为三步:首先,收集细胞上清或直接裂解细胞提取核酸(需用无DNA酶的耗材避免污染);其次,用支原体通用引物(如针对16S rRNA的引物对)进行PCR扩增(变性95℃、退火55℃、延伸72℃,共35个循环);最后,通过琼脂糖凝胶电泳观察目标条带(约150-200bp),或用实时荧光PCR(qPCR)实时监测扩增曲线并定量。

PCR法的优势是“快”(仅需2-4小时)、“准”(能检测到10个拷贝以下的支原体)、“高通量”(可同时检测多个样本)。其中,qPCR还能定量评估感染程度——比如通过Ct值判断样本中支原体的拷贝数,帮助研究者评估污染的严重程度。

需要注意的是,PCR法的关键是“避免污染”:操作时需使用无菌无核酸酶的枪头和离心管,PCR前区(核酸提取)与后区(扩增)需严格分开,同时设置无模板对照(NTC)——若NTC出现条带,说明实验存在污染,结果无效。

荧光染色法:直观的细胞内检测

荧光染色法的原理是利用支原体“高DNA含量”的特点——相对于其体积,支原体的DNA占比远高于细菌,因此用DNA特异性染料(如Hoechst 33258或DAPI)染色后,能在荧光显微镜下看到细胞质内的“点状或丝状荧光”(细胞的核DNA是大块荧光,支原体是小亮点)。

具体步骤包括:将细胞接种到盖玻片上培养24小时,用4%多聚甲醛固定15分钟,0.1%Triton X-100透化5分钟,再用Hoechst 33258(1μg/ml)染色10分钟,最后用荧光显微镜观察(紫外激发)。

这种方法的优势是“直观”——能直接看到支原体在细胞内的分布,适合辅助验证PCR结果;但缺点是“灵敏度低”——只有当支原体数量达到10⁴CFU/ml以上时才能检测到,无法发现早期感染。此外,染色结果的判断依赖操作者经验,容易漏检。

支原体检测的关键注意事项:避免假阳性与假阴性

假阳性是支原体检测中最常见的问题,主要源于“核酸污染”——比如移液器、离心管带有的支原体核酸,或加样时样本溅到其他孔中。避免方法包括:使用一次性无菌无核酸酶的耗材,操作时戴手套并频繁更换枪头,设置无模板对照(NTC)——若NTC出现扩增条带,说明实验环境被污染,需重新操作。

假阴性则多因“样本处理不当”:比如早期感染时支原体数量少,或核酸提取不充分(支原体细胞膜坚韧,需用蛋白酶K或强裂解液裂解)。解决方法是选择灵敏度高的检测方法(如qPCR),并在细胞传代后2-3天检测(此时支原体在上清中积累较多)。

此外,检测范围也很重要——应选择覆盖“细胞培养常见支原体”的方法,比如口腔支原体、肺炎支原体、发酵支原体、精氨酸支原体等,这些支原体占细胞培养感染的90%以上。

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